Piekarnie są miejscem, w którym codziennie wyrabia się świeże pieczywo i ciasta. Ta rutynowa praca może nieść ze sobą jednak pewne zagrożenia sanitarne i zdrowotne. Aby ich unikać określa się możliwe obszary zagrożeń i następnie tworzy procedury zabezpieczające przed ich powstawaniem. Nazywa się to systemem HACCP dla piekarni. Sercem tego systemu jest dokumentacja HACCP zawierająca wszystkie procedury. System HACCP dla piekarni opracowują specjalistyczne firmy konsultingowe. Naturalnie mają one już pewne szablony tworzenia takiego systemu, bo praca ogółu piekarń ma wiele elementów spólnych. Jednak poszczególne piekarnie mogą także mieć swoje własne dodatkowe ryzyka wynikające z ich specyfiki, które też muszą być uwzględnione w ich systemie HACCP.